เรื่องราวของซีรีย์ “The Last Ship Season 1” เปิดฉากด้วยเรือรบยูเอสเอส นาธาน เจมส์ ที่เพิ่งเสร็จสิ้นภารกิจยาวนานกลางทะเลและกำลังมุ่งหน้ากลับบ้าน อย่างไรก็ตาม เหตุการณ์เปลี่ยนแปลงไปเมื่อกัปตันทอม แชนเดอร์ ได้ตัดสินใจช่วยเหลือ ดร.เรเชล สก็อต นักชีววิทยาหญิงลึกลับที่มีความสำคัญต่ออนาคตของมนุษยชาติ
หลังจากการช่วยเหลือ ดร.เรเชล กัปตันแชนเดอร์และลูกเรือบนเรือรบยูเอสเอส นาธาน เจมส์ ได้พบกับข่าวที่น่าตกใจ เมื่อมีโรคระบาดชนิดใหม่ที่ร้ายแรงเริ่มแพร่กระจายไปทั่วโลก โรคดังกล่าวเป็นอันตรายถึงชีวิตและสามารถทำลายล้างมนุษยชาติได้ในเวลาอันสั้น เรือรบยูเอสเอส นาธาน เจมส์ กลายเป็นฐานที่มั่นสุดท้ายที่มนุษยชาติหวังพึ่งพาในการต่อสู้กับเชื้อโรคที่อาจกวาดล้างโลกไปได้
การเดินทางของเรือลำนี้ไม่ใช่เพียงแค่การรอดชีวิตเท่านั้น แต่ยังเป็นการต่อสู้เพื่อหาทางรักษาและป้องกันการระบาดที่ยังคงทวีความรุนแรงอย่างต่อเนื่อง ซีรีย์นี้นำเสนอทั้งการตัดสินใจที่สำคัญในยามวิกฤติ ความลึกลับที่ค่อยๆ เปิดเผย และความพยายามของมนุษย์ในการปกป้องสิ่งที่เหลืออยู่ของโลกที่เคยรู้จัก
